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阿里云携手深势科技,助力泓博医药加速药物研发

2022-12-08




些年来,随着计算机科学及众多基础学科的发展与进步以及“由仿入创”受国家政策支持,基于计算机图形学、数据库技术、人工智能等新技术的药物分子设计不断取得突破性进展,将迎来爆发期。作为新药研发领域的耕耘者,早在去年,泓博医药便与深势科技达成战略合作关系,基于阿里云平台辅助研发,泓博医药计算机辅助药物设计(computer aided drug design, CADD)近年来取得了瞩目成果。




CADD作为泓博医药新药研发服务新的技术利器,能够推动药物设计领域日趋完善,加速了新药成功开发的概率、缩短新药上市周期,更好地帮助药企满足患者未被满足的临床需求。 


药物研发的流程十分复杂,从最早的疾病靶点发现,针对靶点的先导化合物的设计及优化,后续临床候选药的甄选、关键中间体及临床候选药的工艺开发、放大及商业化生产等。



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在临床前的化合物设计与优化阶段,泓博医药与深势科技展开合作,利用深势科技的Hermite药物计算平台,对化合物进行了分子级别的动力学仿真,能够以化学精度高效评估蛋白质与配体的结合情况,实现工业规模的先导化合物优化筛选,提升药物研发效率。


分子级别的仿真意味着肉眼不可见的精细,对算力要求极高,计算200纳秒的分子运动,就需要30 tflops,也就是每秒能进行30万亿次浮点运算的算力,运行数小时才能模拟出来。而药物研发的工作流程上是项目制的,意味着每次需要开出海量算力,计算完就释放掉。这样的需求,非常适合用公共云的弹性高性能算力。




深势科技的Hermite平台加上阿里云高性能计算集群,大幅提升了我们的分子模拟效率,降低了泓博科技的合成成本,减少了定制合成的等待时间,管线推进到临床前候选化合物的时间也缩短了一半。目前我们能够在10-15小时内完成一次自由能计算,实现一天内数千通量级的候选化合物亲和力准确评估。



同时,通过阿里云计算巢,可以随时审计到深势科技的操作,这样的透明度提升实验安全度。


未来,泓博医药将巩固目前的合成技术优势,加速拓展计算机辅助药物设(CADD)、人工智能辅助药物设计(AIDD)领域技术,深度参与到客户的新药发现项目,为客户提供高效和优质药物化学设计服务。

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